1. Генетичний код

Генетичний код — це система запису генетичної інформації про послідовність розташування амінокислот у білках у вигляді послідовності нуклеотидів у ДНК або РНК.

Кожній амінокислоті білка відповідає послідовність з трьох розташованих один за одним нуклеотидів ДНК — триплет .

Кожен триплет нуклеотидів кодує певну амінокислоту, яка буде вбудована у поліпептидний ланцюг.

Як відомо, до складу ДНК можуть входити чотири нітрогеновмісних основи: аденін ( А ), гуанін ( Г ), тимін ( Т ) і цитозин ( Ц ). Число сполучень з \(4\) по \(3\) складає 4 3 = 64 , тобто ДНК може кодувати \(64\) амінокислоти. Проте кодується тільки \(20\) амінокислот.

Виявилося, що багатьом амінокислотам відповідає не один, а декілька кодонів. Передбачається, що така властивість генетичного коду (виродженність) підвищує надійність зберігання і передачі генетичної інформації під час ділення клітин.

амінокислоті аланіну відповідає \(4\) триплета — ЦДА, ЦГГ, ЦГТ і ЦГЦ. Звідси випливає, що випадкова помилка у третьому нуклеотиді кодону не зможе привести до змін у структурі білка — у будь-якому випадку це буде кодон аланіну.

На даний час складена карта генетичного коду , тобто відомо, які триплети у ДНК відповідають тій чи іншій з \(20\) амінокислот, що входять до складу білків.

Правила користування таблицею:

Перший нуклеотид у триплеті береться з лівого вертикального рядка, другий — з верхнього горизонтального рядка, а третій — з правого вертикального. Там, де будуть перетинатися лінії, що ідуть від усіх трьох нуклеотидів, і буде назва потрібної амінокислоти.

Оскільки у молекулі ДНК містяться сотні генів, то до її складу обов’язково входять триплети — стоп-кодони , які є «знаками пунктуації» і позначають початок або кінець того чи іншого гена.

1. Код складається з триплетів. Одна амінокислота кодується трьома нуклеотидами.
2. Код є універсальним. Усі живі організми (від бактерії до людини) використовують єдиний генетичний код.
3. Код є виродженим. Одна амінокислота кодується більш, ніж одним кодоном.
4. Код є однозначним. Кожен триплет відповідає тільки одній амінокислоті.
5. Код не перекривається. Один нуклеотид не може входити до складу декількох кодонів у ланцюгу РНК.

Послідовність нуклеотидів у молекулі ДНК визначає її специфічність, а також специфічність білків організму, які кодуються цією послідовністю. Ці послідовності індивідуальні і для кожного виду організмів, і для окремих особин виду.

6.5: Генетичний код

Якщо хтось запитає вас, чи можете ви код, ви, ймовірно, припускаєте, що вони мають на увазі комп’ютерний код. Зображення на малюнку \(\PageIndex<1>\) являє собою важливий код, який ви використовуєте весь час, але не з комп’ютером. Це генетичний код, який використовується вашими клітинами для зберігання інформації та створення білків. Малюнок \(\PageIndex<1>\) : Логотип генетичного коду FACIL

Що таке генетичний код?

Генетичний код складається з послідовності азотних основ в полінуклеотидному ланцюжку ДНК або РНК. Підставами є аденін (А), цитозин (С), гуанін (G) і тимін (Т) (або урацил, U, в РНК). Чотири основи складають «букви» генетичного коду. Букви об’єднані в групи по три, утворюючи кодові «слова», звані кодонами. Кожен кодон розшифровується як (кодує) одну амінокислоту, якщо вона не кодує сигнал запуску або зупинки. У білках 20 загальних амінокислот. З чотирма основами, що утворюють трибазові кодони, існує 64 можливих кодонів. 61 кодону більш ніж достатньо для коду 20 амінокислот, таким чином, більше одного кодону для однієї амінокислоти. Генетичні коди можна знайти в таблиці \(\PageIndex\) або в додатку 1.

Таблиця \(\PageIndex\) : Діаграма кодонів. Щоб знайти амінокислоту для конкретного кодону, знайдіть клітину в таблиці для першого, другого і третього підстав кодону. Після того, як ви знайшли кодон, ви можете знайти відповідну амінокислоту в сусідній клітині на правій стороні клітини кодона. Наприклад, коди CUG для лейцину (Leu), AAG коди для лізину (Lys) і GGG коди для гліцину (Gly). Тільки текстова версія діаграми кодонів.

Друга база U	Амінокислота	Друга база C	Амінокислота	Друга база A	Амінокислота	Друга база G	Амінокислота
Перша база U	УУУ	Фе	УКУ	Сер	УАУ	Тир	УГУ	Cys	Третя база U
Перша база U	УУЦ	Фе	УСС	Сер	УАК	Тир	УГК	Cys	Третя база C
Перша база U	УУА	Лей	УКА	Сер	УАА	(стоп) немає амінокислоти	ГУГА	(стоп) немає амінокислоти	Третя база A
Перша база U	УУА	Лей	UCG	Сер	ГРAG	(стоп) немає амінокислоти	УГГІ	Трп	Третя база G
Перша база C	КУУ	Лей	CCU	Про	КАУ	Його	CGU	Арг	Третя база U
Перша база C	КУС	Лей	CCC	Про	CAC	Його	CGC	Арг	Третя база C
Перша база C	КУА	Лей	CCA	Про	CAA	Глен	CGA	Арг	Третя база A
Перша база C	КУГ	Лей	ККГ	Про	КЛІТИНА	Глен	CGG	Арг	Третя база G
Перша база A	АУУ	Іль	АКУ	Thr	ААУ	Асн	АГУ	Сер	Третя база U
Перша база A	АУК	Іль	АКК	Thr	AAC	Асн	АГЦ	Сер	Третя база C
Перша база A	АУА	Іль	АКА	Thr	ААА	Лис	АГА	Арг	Третя база A
Перша база A	СЕРП	Зустріти (старт)	АКГ	Thr	ААГ	Лис	АГГ	Арг	Третя база G
Перша база G	ГУУ	Вал	ГКУ	Ала	ГАУ	жерех	ГГУ	Гли	Третя база U
Перша база G	ГУК	Вал	GCC	Ала	ГАК	жерех	GGC	Гли	Третя база C
Перша база G	ГУА	Вал	GCA	Ала	ГАА	Глю	ГГА	Гли	Третя база A
Перша база G	ГУГ	Вал	GCG	Ала	КЛЯП	Глю	ГГГ	Гли	Третя база G

Читання генетичного коду

Якщо ви знайдете кодон AUG в таблиці \(\PageIndex<1>\) , ви побачите, що він кодує амінокислоту метіонін. Цей кодон також є стартовим кодоном, який встановлює кадр зчитування коду. Рамка для читання – це спосіб поділу основ на кодони. Вона проілюстрована на рис \(\PageIndex\) . Після стартового кодону AUG (не показаний на зображенні) наступні три основи читаються як другий кодон. Наступні три основи після цього читаються як третій кодон і так далі. Послідовність основ читається, кодон кодоном, поки не буде досягнутий стоп-кодон. UAG, UGA та UAA – це всі стоп-кодони. Вони не кодують для будь-яких амінокислот. Малюнок \(\PageIndex\) : Читання генетичного коду. Генетичний код зчитується трьома основами одночасно. Кодони – це кодові слова генетичного коду.

Характеристика генетичного коду

• Генетичний код універсальний. Всі відомі живі істоти мають один і той же генетичний код. Це показує, що всі організми мають спільну еволюційну історію.
• Генетичний код однозначний. Це означає, що кожен кодон кодує тільки для однієї амінокислоти (або запуску або зупинки). Це необхідно, щоб не виникало питання про те, яка амінокислота правильна.
• Генетичний код надлишковий. Це означає, що кожна амінокислота закодована більш ніж одним кодоном. Наприклад, в таблиці вище чотири кодони коду для амінокислоти треонін. Надмірність в коді допомагає запобігти помилкам синтезу білка. Якщо база в кодоні змінюється випадково, є хороший шанс, що він все одно буде код для тієї ж амінокислоти.

Рецензія

1. Опишіть генетичний код.
2. Поясніть, як читається генетичний код.
3. Визначте три важливі характеристики генетичного коду.
4. Підсумуємо, як був розшифрований генетичний код.
5. Використовуйте таблицю під назвою «Генетичний код», наведену вище, щоб відповісти на наступні питання.
   1. Чи зображений код в таблиці з ДНК або РНК? Поясніть свої міркування.
   2. Для якої амінокислоти кодон CAA код?
   3. Чи має UGA код для амінокислоти? Чому чи чому ні? Якщо так, то який з них?
   4. Подивіться на кодони, які код для амінокислоти гліцин. Скільки їх там? У чому їх схожість і відмінність один від одного?
   5. Уявіть, що ви проводите експеримент, подібний до того, який проводили Ніренберг та Маттеї з 20 пробірками, кожна з яких містить вміст клітин бактерій та всі 20 амінокислот, з одним типом амінокислоти, позначені в кожній трубці. Якби ви додали синтетичну РНК, що містить тільки базовий цитозин, поліпептидний ланцюг, що складається з якої амінокислоти буде вироблятися? Поясніть свою відповідь.
   1. 64
   2. 20
   3. 3
   4. Це залежить від виду
   1. 64
   2. 20
   3. 3
   4. 4

   Дізнатися більше

   Порівняння послідовностей ДНК є життєво важливим для розуміння еволюційних взаємозв’язків між організмами. Перевірте більше тут:

   Атрибуції:

   1. Логотип Генетичного коду Бас Е. Дутільх та ін., ліцензований CC BY 2.5 через Wikimedia Commons
   2. Генетичний код від Madprime, публічне надбання через Вікісховище
   3. Текст адаптований з біології людиниCK-12 ліцензований CC BY-NC 3.0

   Recommended articles

   1. Article type Section or Page License CK-12 License Version 3.0 Show Page TOC Yes on Page
   2. Tags
      1. authorname:mgrewal
      2. cssprint:dense
      3. genetic code
      4. program:oeri
      5. source@https://www.ck12.org/book/ck-12-human-biology/
      6. source[translate]-bio-16750

      13: Генетичний код

      Експерименти з тестуванням ефектів мутацій зрушення кадру показали, що видалення або додавання 1 або 2 нуклеотидів викликало втрату функції, тоді як видалення або додавання нуклеотидів 3 дозволило зберегти значну функцію. Це продемонструвало, що одиницею кодування є 3 нуклеотиди. Нуклеотидний триплет, який кодує амінокислоту, називається кодоном. Кожна група з трьох нуклеотидів кодує по одній амінокислоті. Оскільки існує 64 комбінації з 4 нуклеотидів, взятих по три за раз і всього 20 амінокислот, код є виродженим (більше одного кодону на амінокислоту, в більшості випадків). Молекулою адаптера для перекладу є тРНК. Заряджена тРНК має амінокислоту на одному кінці, а на іншому – антикодон для узгодження кодону в мРНК; тобто. він «говорить мовою» нуклеїнових кислот на одному кінці і «мовою» білків на іншому кінці. Машиною синтезу білків під керівництвом шаблонної мРНК є рибосома. Малюнок 3.4.1 ТРНК служать адаптером для перекладу з нуклеїнової кислоти в білок

      А. розмір кодону: 3 нуклеотиди

      1. Три – мінімальна кількість нуклеотидів на кодон, необхідне для кодування 20 амінокислот. а. 20 амінокислот кодуються комбінаціями з 4 нуклеотидів б Якби кодон був двома нуклеотидами, набір всіх комбінацій міг кодувати тільки 4х4 = 16 амінокислот. с. з трьома нуклеотидами набір всіх комбінацій може кодувати 4x4x4 = 64 амінокислоти (тобто 64 різних комбінації з чотирьох нуклеотидів, взятих по три за раз). 2. Результати комбінацій мутацій зсуву кадрів показують, що код знаходиться в трійках. Мутації, що змінюють довжину, які додають або видаляють один або два нуклеотиди, мають серйозний дефектний фенотип (вони змінюють кадр зчитування, тому вся послідовність амінокислот після мутації змінюється.). Але ті, які додають або видаляють три нуклеотиди, мало або зовсім не впливають. В останньому випадку кадр зчитування підтримується, з введенням або видаленням амінокислоти на одній ділянці. Комбінації трьох різних одиничних нуклеотидних делецій (або вставок), кожна з яких має фенотип втрати функції окремо, можуть відновити істотну функцію гена. Кадр читання wild типу відновлюється після 3-го видалення (або вставки).

      Б. експерименти з розшифровки коду

      1. Було розроблено кілька різних безклітинних систем, які каталізують синтез білка. Ця здатність здійснювати переклад in vitro була одним із технічних досягнень, необхідних для того, щоб дозволити дослідникам визначити генетичний код. а. ретикулоцити ссавців (кролика): рибосоми активно виробляють багато глобіну. б. екстракти зародків пшениці c Бактеріальні екстракти 2. Здатність синтезувати випадкові полінуклеотиди була ще однією ключовою розробкою, яка дозволила експериментам розшифрувати код. S. Ochoa виділив фермент полінуклеотидфосфорилазу і показав, що він здатний зв’язувати нуклеозиди ді фосфати (НДП) в полімери НМП (РНК) в оборотній реакції. nNDP n + NPi Фізіологічна функція полінуклеотидної фосфорилази полягає в каталізації зворотної реакції, яка використовується при деградації РНК. Однак у безклітинній системі пряма реакція дуже корисна для виготовлення випадкових РНК полімерів. 3. Гомополімери програмують синтез специфічних гомо-поліпептидів (Nirenberg and Matthei, 1961). а Якщо ви надаєте лише UDP як субстрат для полінуклеотидної фосфорилази, продукт буде гомополімерним полі (U). б Додавання полі (U) до системи перекладу in vitro (наприклад, лізатів кишкової палички) призводить до нещодавно синтезованого поліпептиду, який є полімером поліфенілаланіну. c. таким чином UUUU кодує Phe. d Аналогічно, полі (А) запрограмований синтез Poly‑LYS; AAA кодує Lys. Полі (C) запрограмований синтез Poly‑Pro; CCC кодує Pro. Полі (G) запрограмований синтез Poly‑GLY; GGG кодує Gly. 4. Використання змішаних сополімерів а Якщо два НДФ змішуються у відомому співвідношенні, полінуклеотидна фосфорилаза утворює змішаний сополімер, в який нуклеотид включений з частотою, пропорційною його присутності в вихідній суміші. б Наприклад, розглянемо суміш 5:1 A: C Фермент буде використовувати ADP 5/6 часу, і CDP 1/6 часу. Прикладом можливого продукту є: ААКААААААААААААААААААААААААААА

      Таблиця 3.4.1. Частота триплетів у полі (AC) (5:1) випадковому сополімері

      Склад	Число	Імовірність	Відносна частота
      3 А	1	0,578	1.0
      2 А, 1 СМ	3	3 х 0,116	3 х 0,20
      1 А, 2 СМ	3	3 х 0,023	3 х 0,04
      3 СМ	1	0,005	0,01

      c Таким чином, частота, що AAA буде відбуватися в сополімері, дорівнює (5/6) (5/6) (5/6) = 0,578. Це буде найбільш часто зустрічається кодон, і його можна нормалізувати до 1,0 (0,578/0,578 = 1,0) d Частота, яку буде відбуватися кодон з 2 А і 1 С, дорівнює (5/6) (5/6) (1/6) = 0,116. Є три способи мати 2 А і 1 С, тобто AAC, ACA і CAA. Так частота виникнення всіх кодонів A2C дорівнює 3 х 0,116. Нормалізуючи на ААА, що має відносну частоту 1,0, частота кодонів A2C дорівнює 3 х (0,116/0,578) = 3 х 0,2. е. аналогічна логіка показує, що очікувана частота кодонів AC2 становить 3 х 0,04, а очікувана частота CCC дорівнює 0,01.

      Таблиця 3.4.2. Включення амінокислот з полі (AC) (5:1) як шаблон

      Радіоактивний	Осадова cpm		Спостерігається		Теоретичний
      амінокислоти	– шаблон	+ шаблон		включення		включення
      Лізин	60	4615		100.0		100
      Треонін	44	1250		26.5		24
      аспарагін	47	1146		24.2		20
      Глютамин	39	1117		23.7		20
      Пролін	14	342		7.2		4.8
      Гістидин	282	576		6.5		4

      Ці дані взяті з Speyer et al. (1963) Симпозіум Cold Spring Harbor з кількісної біології, 28:559. Теоретичне включення – це очікуване значення, враховуючи генетичний код, як він був згодом визначений. f Коли ця суміш змішаних сополімерів використовується для програмування перекладу in vitro, Lys включається найчастіше, що може бути виражено як 100. Це підтверджує, що AAA кодує Lys. г Відносно Lys включення як 100, Thr, Asn і Gln включені зі значеннями від 24 до 26, дуже близькі до очікування для амінокислот, кодованих одним з кодонів A2C. Однак ці дані не показують, який з кодонів A2C кодує кожну конкретну амінокислоту. Тепер ми знаємо, що ACA кодує Thr, AAC кодує Asn, а CAA кодує Gln. h Pro і His включені зі значеннями 6 і 7, що близьке до очікуваних 4 для амінокислот, кодованих кодонами AC2. Наприклад, CCA кодує Pro, CAC кодує його. ACC кодує Thr, але це включення затьмарюється «26.5″ одиницями реєстрації в ACA. Або, точніше, «26.5» @ 20 (ACA) + 4 (АСС) для Thr. 5. Визначені тринуклеотидні кодони стимулюють зв’язування аміноацил‑ТРНК з рибосомами а. при високих концентраціях катіонів Mg 2+ нормальний механізм ініціювання, що вимагає F‑met‑TRNAF, може бути змінений, а визначені тринуклеотиди можуть бути використані для прямого зв’язування окремих мічених аміноацил‑ТРНК з рибосомами. б. Наприклад, якщо рибосоми змішуються з UUU та радіомаркованим PHE-trNaphe, за цих умов утворюється потрійний комплекс, який буде прилипати до нітроцелюлози («аналіз Millipore», названий на честь виробника нітроцелюлози). c Потім можна перевірити всі можливі комбінації триплетних нуклеотидів. Малюнок 3.4.2. Дані Ніренберга та Ледера (1964) Наука 145:1399. 6. Повторювана послідовність синтетичних полінуклеотидів (Хорана) a. чергуються сополімери: наприклад (UC) в програмах включення Ser і Leu. Так УКУ і CUC кодують Сер і Лей, але не можуть сказати, що є що. Але в поєднанні з іншими даними, наприклад випадковими змішаними сополімерами в розділі 4 вище, можна зробити деякі остаточні визначення. Така подальша робота показала, що УКУ кодує Ser і CUC кодує лей. b. Полі (AUG) програми включення Poly‑MET та Poly‑ASP при високих концентраціях Mg. AUG кодує Met, UGA – це зупинка, тому ГУА повинен кодувати Asp.

      C. Генетичний код

      Шляхом складання спостережень з експериментів, таких як описані в попередньому розділі, була визначена кодувальна здатність кожної групи з 3 нуклеотидів. Це іменується генетичним кодом. Вона зведена в табл. 3.4.4. Це говорить нам про те, як клітина перекладається з «мови» нуклеїнових кислот (полімерів нуклеотидів) на білки (полімери амінокислот). Таблиця 3.4.4. Генетичний код Положення в Кодоні

      1-й

      2-й.

      3-й

      У.

      С.

      А.

      Г.

      У

      УУУ

      Фе

      УКУ

      Сер

      УАУ

      Тир

      УГУ

      Cys

      У

      УУЦ

      Фе

      UCC

      Сер

      УАК

      Тир

      УГК

      Cys

      C

      УУА

      Лей

      УКА

      Сер

      УАА

      Термін

      ГУГА

      Термін

      A

      УУГ

      Лей

      УСГ

      Сер

      АГ

      Термін

      УГГІ

      Трп

      Г

      C

      КУУ

      Лей

      CCU

      Про

      КАУ

      Його

      CGU

      Арг

      У

      КУС

      Лей

      CCC

      Про

      CAC

      Його

      CGC

      Арг

      C

      КУА

      Лей

      CCA

      Про

      CAA

      Глен

      CGA

      Арг

      A

      КУГ

      Лей

      ККГ

      Про

      КЛІТКА

      Глен

      CGG

      Арг

      Г

      A

      АУУ

      Іль

      АКУ

      Thr

      ААУ

      Асн

      АГУ

      Сер

      У

      АУК

      Іль

      АКК

      Thr

      AAC

      Асн

      АГЦ

      Сер

      C

      АУА

      Іль

      АКА

      Thr

      ААА

      Лис

      АГА

      Арг

      A

      СЕРПЕНЬ*

      Зустріли

      АКГ

      Thr

      ААГ

      Лис

      АГГ

      Арг

      Г

      Г

      ГУУ

      Вал

      ГКУ

      Ала

      ГАУ

      Жерех

      ГГУ

      Гли

      У

      ГУК

      Вал

      GCC

      Ала

      ГАК

      Жерех

      GGC

      Гли

      C

      ГУА

      Вал

      GCA

      Ала

      ГАА

      Глю

      ГГА

      Гли

      A

      ГУГ*

      Вал

      GCG

      Ала

      КЛЯП

      Глю

      ГГГ

      Гли

      Г

      2. Із загальної кількості 64 кодонів 61 кодує амінокислоти і 3 вказують припинення перекладу.

      3. Виродження

      Виродження генетичного коду відноситься до того, що більшість амінокислот уточнюється більш ніж одним кодоном. Виняток становлять метіонін (AUG) і триптофан (UGG). Виродження зустрічається в першу чергу третя позиція. Отже, одиночні нуклеотидні заміни на третій позиції можуть не привести до зміни закодованої амінокислоти. Вони називаються безшумними або синонімічними замінами нуклеотидів і не змінюють закодований білок. Про це більш детально розглянуто нижче. Патерн виродження дозволяє організувати кодони на “сім’ї” та “пари». У 9 групах кодонів нуклеотидів на перших двох позиціях достатньо, щоб вказати унікальну амінокислоту, а будь-який нуклеотид (скорочено N) на третій позиції кодує ту саму амінокислоту. До них належать 9 кодонових «сімейств». Прикладом може служити ACN кодування треонін. Існує 13 кодонових «пар», в яких нуклеотидів на перших двох позиціях досить вказати дві амінокислоти. Нуклеотид пурину (R) у третій позиції визначає одну амінокислоту, тоді як нуклеотид піримідину (Y) у третій позиції визначає іншу амінокислоту. Ці приклади додають до більш ніж 20 (кількість амінокислот), оскільки лейцин (кодується UUR та CUN), серин (кодується UCN та AGY) та аргінін (кодується CGN та AGR) кодуються як сімейством кодонів, так і кодоновою парою. Кодони UAR, що вказують на припинення перекладу, зараховувалися як кодонова пара. Три кодони, що кодують ізолейцин (AUU, AUC та AUA), знаходяться на півдорозі між сімейством кодонів та парою кодонів.

      4. Хімічно схожі амінокислоти часто мають схожі кодони.

      5. Основним кодоном, що визначає ініціацію перекладу, є AUG

      • AUG використовується для 3542 генів.
      • GUG використовується для 612 генів.
      • УУГ використовується для 130 генів.
      • AUU використовується для 1 гена.
      • CUG може бути використаний для 1 гена.

      Незалежно від того, який кодон використовується для ініціації, перша амінокислота, включена під час трансляції, – це F-мет у бактерій.

      6. Три кодони вказують припинення перекладу: UAA, UAG, UGA.

      З цих трьох кодонів УАА використовується найчастіше в кишковій паличці, а потім УГА. UAG використовується набагато рідше.

      • УАА використовується для 2705 генів.
      • УГА використовується для 1257 генів.
      • УАГ використовується для 326 генів.

      7. Генетичний код практично універсальний

      У рідкісних винятках з цього правила відмінності від генетичного коду досить малі. Наприклад, одним винятком є РНК з мітохондріальної ДНК, де і UGG, і UGA кодують Trp.

      D. диференціальне використання кодонів

      1. Різні види мають різні моделі використання кодонів: Наприклад, можна використовувати 5′ UUA для кодування Leu 90% часу (визначається нуклеотидними послідовностями багатьох генів). Він може ніколи не використовувати CUR, а комбінація UUG плюс CUY може становити 10% кодонів.

      2. Велика кількість тРНК корелює з використанням кодонів у природних мРНК: У цьому прикладі TrnAleu з 3′ AAU на антикодоні буде найбільш поширеним.

      3. Схема використання кодонів може бути предиктором рівня експресії гена: Загалом, більш виражені гени, як правило, використовують кодони, які часто використовуються в генах в решті частини генома. Це було кількісно оцінено як «індекс адаптації кодонів». Таким чином, аналізуючи повні геноми, раніше невідомий ген, профіль використання кодону якого відповідає бажаному використанню кодону для організму, високо оцінював би індекс адаптації кодону, і можна було б припустити, що це високоекспресований ген. Так само той, хто має низький бал за індексом, може кодувати білок з низькою кількістю.

      Спостереження за геном із схемою використання кодону, яка суттєво відрізняється від решти генома, вказує на те, що цей ген, можливо, потрапив у геном шляхом горизонтального перенесення від іншого виду.

      4. Переважне використання кодону є корисним міркуванням у «зворотній генетиці»: Якщо ви знаєте навіть часткову послідовність амінокислот для білка і хочете виділити ген для нього, сімейство послідовностей мРНК, які можуть кодувати цю послідовність амінокислот, можна легко визначити. Через виродження в коді це сімейство послідовностей може бути дуже великим. Оскільки ці послідовності, ймовірно, будуть використовувати як зонди гібридизації або як праймери ПЛР, чим більше сімейство можливих послідовностей, тим більша ймовірність того, що можна отримати гібридизацію до цільової послідовності, яка відрізняється від бажаної. Таким чином, хочеться обмежити кількість можливих послідовностей, і, посилаючись на таблицю переваг кодонів (припускаючи, що вони відомі для організму, що цікавить), то можна використовувати бажані кодони, а не всі можливі кодони. Це обмежує кількість послідовностей, які потрібно зробити як зонди гібридизації або праймери.

      Е. коливання в антикодоні

      Ця гнучкість в положенні «коливання» дозволяє деяким ТРНК з’єднуватися з двома або трьома кодонами, тим самим зменшуючи кількість ТРНК, необхідних для перекладу. Наступні правила «коливання» означають, що 61 кодон (для 20 амінокислот) можна прочитати лише 31 антикодон (або 31 тРНК).

      Окрім звичайних базових пар, можна мати пари G‑U, а I у 1-й позиції антикодону можна з’єднати з U, C або A (правила коливання).

      5′ основа антикодону = 3′ база кодону =

      перша позиція в третю позицію тРНК в мРНК